以重大动物疫病、人畜共患病等为对象，开展政策、基础、应用等研究，为科技自立自强提供战略支撑。
优机制、推年轻、强领军、补短板、抓管理，统筹推进研究所人才队伍建设。
坚持四个面向，服务三农，落实“三创一体”战略，提升科技支撑能力和成果转化水平。
以平台建设为抓手，服务支撑科技创新，推动研究所科技创新能力高质量发展
以管理为主线，以协调为核心，以服务为根本，为科研创新高质量发展保驾护航。
求真笃行 锐意创新
团结协作 追求卓越
增进实力
彰显魅力
激发活力
凝聚合力
研究所扎实推进精神文明建设工作，营造团结进取良好氛围，引导广大干部职工听党话、感党恩、跟党走，立足岗位建功立业。近年来，上海兽医所荣获第五届全国文明单位、上海市文明单位、中国农业科学院文明单位、上海市平安示范单位、中国农业科学院平安建设优秀单位等荣誉称号。
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