中国农业科学院上海兽医研究所位于上海市闵行区，成立于1964年，其前身为中国农业科学院 家畜血吸虫病研究室，1982年更名为中国农业科学院上海家畜血吸虫病研究所，1989年更名为中国农业科学院上海家畜寄生虫病硏究所，2002年被列为国家非营利性科研机构，2006年更名为中国农业科学院上海兽医硏究所，并成立中国动物卫生与流行病学中心上海分中心。2021年3月，中国农业科学院委托研究所成立了生物安全研究中心。

以习近平新时代中国特色社会主义思想为指导，落实”四个面向""两个一流”和"一个整体跃升”的总要求，贯彻"人病兽防、关口前移、源头治理”的重要指示，聚焦国家农业生物安全"主责主业"，围 绕"国之大者"抓主抓重，以重大动物疫情、人畜共患病、重大外来病等为对象，开展生物安全公共政策、基础理论、监测预警、技术攻关、产品研发、集成应用等全链条研究，为保障国家农业生物安全、 科技自立自强提供战略支撑。

研究所现有在职职工146名，高级职称专家77名，硕博导师67人。内设7个行政管理部门和6个研 究室，建立了11个创新科研团队。依托研究所建有国家防治血吸虫病参考实验室、农业农村部动物生 物安全风险预警及防控重点实验室（北方）等10个科技平台，编辑出版《中国动物传染病学报》。

建所以来，承担各类科研项目1000余项。获得国家省部级奖励成果68项；获得国家各类新兽药证书15项，其中一类新兽药证书4项；发表论文2800余篇，其中SCI收录论文1000余篇；出版专著76部；获得国家发明专利129件。

研究所连续四届被授予全国血防先进集体称号，获评第五届全国文明单位、历届上海市文明单位，多次获评中国农业科学院文明单位。